En ce qui concerne les procédures de dépôt et de survie des micro-organismes, en raison de l'existence du Traité de Budapest, les pays du monde entier se conforment généralement aux procédures de dépôt de matériel biologique, ce qui facilite les demandes internationales PCT. Toutefois, comme Taïwan n’est pas membre du traité, même si les matières biologiques sont déposées conformément au Traité de Budapest, les déposants à Taïwan doivent toujours les déposer localement dans une institution de dépôt reconnue par l’Office de la propriété intellectuelle de Taïwan. Actuellement, il n'existe à Taiwan qu'une seule institution qualifiée pour la préservation et la survie des micro-organismes impliqués dans les demandes de brevet, à savoir l'Institut de recherche sur le développement de l'industrie alimentaire (FIRDI) à Hsinchu, Taiwan. Conformément à la réglementation, les demandeurs doivent soumettre le dépôt et le certificat de survie à l'Office de la propriété intellectuelle dans les 4 mois suivant la date de la demande de brevet. Dans le cas contraire, le processus de demande de brevet pourrait être affecté en raison du défaut de soumission des certificats pertinents à temps.
Du point de vue de la stratégie d'entreprise, les demandeurs de brevets ne doivent pas seulement prendre en compte le dépôt de matériel biologique, mais également comprendre à l'avance les approbations administratives impliquées dans les importations, telles que l'obtention de permis auprès de l'administration des douanes, du ministère de l'Agriculture ou du ministère de la Santé et du Bien-être. Toutefois, sur la base de l’expérience pratique sur le terrain, le délai d’approbation spécifique est incertain et certains matériaux biologiques peuvent rencontrer des obstacles dans les permis d’importation. De plus, les procédures de quarantaine douanière retarderont encore davantage la finalisation du dépôt. De plus, FIRDI a besoin de 3 à 4 semaines après réception de l'échantillon pour confirmer la cultivabilité et la viabilité du matériel avant de délivrer les documents de certification nécessaires.
Le coût du dépôt et de la maintenance des micro-organismes au FIRDI est d’environ 1 200 à 1 800 USD. Les coûts de stockage peuvent être élevés si des matériaux biologiques spéciaux sont impliqués, ainsi que les éventuels frais de transport et de dédouanement.
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